1873（明治6）年5月現在の東京都千代田区に設置された。陸軍部内者や東京鎮台兵・近衛兵の治療を担った。旧軍医寮の取扱事務も継承した。同年10月本病院内に軍医学校が置かれた。1879年10月陸軍軍医本部の管轄となった。1881年6月東京陸軍病院と改称された。1886年2月に東京鎮台の管轄となり東京鎮台病院と改称された。

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「３０　近衛解兵の者賞勲渡方　大蔵省事務総裁　大隈参議　東京鎮台　東京営所閉営の儀　松本軍医総監　陸軍本病院　兵営其他各所轄建物の漸次新築修繕」Ref：C08052141000、「軍医学校規則ヲ定ム」Ref：A03023234800、「陸軍軍医本部を置く」Ref：C08070908700、「軍医部条例中改正」Ref：C08070967100、東京陸軍病院ヲ東京鎮台ノ所属トシ東京鎮台病院ト改称ス」Ref：A15111150900）。